47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0509 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1429    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  41.57 
 
 		 740 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  41.15 
 
 		 719 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  36.93 
 
 		 842 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  37.67 
 
 		 769 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  38.31 
 
 		 941 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  41.56 
 
 		 787 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  37.5 
 
 		 835 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  42.9 
 
 		 799 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  42.9 
 
 		 799 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  33.68 
 
 		 846 aa  201  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  35.09 
 
 		 848 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  36.84 
 
 		 907 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  36.84 
 
 		 857 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  36.84 
 
 		 857 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  36.49 
 
 		 915 aa  196  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  36.64 
 
 		 871 aa  193  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  35.4 
 
 		 856 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  35.75 
 
 		 904 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  36.91 
 
 		 874 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  35.1 
 
 		 856 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  35 
 
 		 857 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  34.19 
 
 		 639 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  34.8 
 
 		 855 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  33.51 
 
 		 858 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  34.63 
 
 		 762 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  37.43 
 
 		 367 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  37.43 
 
 		 367 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  34.04 
 
 		 680 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  29.47 
 
 		 704 aa  127  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  28.98 
 
 		 790 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  26.17 
 
 		 459 aa  87.8  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  44.26 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  38.12 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  28.64 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  23.94 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  40 
 
 		 485 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  32.31 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  36.03 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  31.32 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  27.53 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  29.82 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.22 
 
 		 3409 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  21.69 
 
 		 490 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  23.82 
 
 		 848 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  20.67 
 
 		 3521 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.69 
 
 		 2914 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>