49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1045 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  70.97 
 
 
904 aa  1044    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  61.11 
 
 
857 aa  842    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  83.58 
 
 
856 aa  1269    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  97.9 
 
 
855 aa  1475    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  83.82 
 
 
856 aa  1272    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  59.37 
 
 
848 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  61 
 
 
857 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  100 
 
 
858 aa  1682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  58.14 
 
 
871 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  57.83 
 
 
874 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  59.72 
 
 
915 aa  817    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  90.37 
 
 
857 aa  1391    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  60.7 
 
 
907 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  76.8 
 
 
367 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  76.8 
 
 
367 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  42.73 
 
 
799 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  53.55 
 
 
799 aa  422  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  47.55 
 
 
787 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  46.39 
 
 
846 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  44.87 
 
 
941 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  44.65 
 
 
835 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  45.68 
 
 
769 aa  357  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  47.68 
 
 
842 aa  343  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  37.27 
 
 
762 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  46.46 
 
 
639 aa  323  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  36.84 
 
 
719 aa  266  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  43.79 
 
 
790 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  47.54 
 
 
464 aa  260  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  35.07 
 
 
740 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  34.17 
 
 
741 aa  188  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  35.93 
 
 
680 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  29.84 
 
 
704 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2521  translation initiation factor 2  42.16 
 
 
372 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.75 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  32.28 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  50.62 
 
 
490 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  23.85 
 
 
848 aa  77.8  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  44.74 
 
 
488 aa  77.4  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  44.33 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  41.53 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  36.75 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  38.76 
 
 
485 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  38.76 
 
 
473 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  39.68 
 
 
487 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  41.05 
 
 
341 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  27.53 
 
 
586 aa  57.4  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  27.57 
 
 
209 aa  55.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  19.74 
 
 
3409 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  37.93 
 
 
268 aa  46.6  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>