46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4100 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  100 
 
 		 740 aa  1440    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  42.2 
 
 		 719 aa  290  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  42.89 
 
 		 741 aa  284  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  40.55 
 
 		 842 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  42.67 
 
 		 941 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  36.6 
 
 		 769 aa  267  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  40.32 
 
 		 787 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  38.25 
 
 		 848 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  40.28 
 
 		 639 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  35.4 
 
 		 857 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  35.4 
 
 		 857 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  35.62 
 
 		 907 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  30.96 
 
 		 846 aa  248  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  37.68 
 
 		 871 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  38.34 
 
 		 835 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  37.68 
 
 		 874 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  36.68 
 
 		 904 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  37.56 
 
 		 799 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  35.06 
 
 		 857 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  37.98 
 
 		 799 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  36.3 
 
 		 915 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  35.92 
 
 		 762 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  34.9 
 
 		 856 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  38.39 
 
 		 856 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  34.16 
 
 		 858 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  34.89 
 
 		 855 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  38 
 
 		 367 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  38 
 
 		 367 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  37.43 
 
 		 680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  30.43 
 
 		 790 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  28.37 
 
 		 704 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  28.93 
 
 		 784 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.72 
 
 		 459 aa  98.6  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  31.15 
 
 		 472 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  31.87 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  33.74 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  27.23 
 
 		 848 aa  75.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  40.98 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  31.34 
 
 		 488 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  39.83 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25.93 
 
 		 3409 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  35.9 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  22.55 
 
 		 3521 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.56 
 
 		 2449 aa  47  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  24.64 
 
 		 3472 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  24.64 
 
 		 3471 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>