49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2894 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  58.3 
 
 
904 aa  802    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  98.91 
 
 
367 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  98.88 
 
 
464 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  98.91 
 
 
367 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  60.21 
 
 
856 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  54.81 
 
 
848 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  60.67 
 
 
855 aa  817    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  60.21 
 
 
856 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  58.81 
 
 
871 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  99.65 
 
 
857 aa  1663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  100 
 
 
857 aa  1669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  58.78 
 
 
874 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  86.55 
 
 
915 aa  1340    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  61.8 
 
 
857 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  97.78 
 
 
907 aa  1519    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  60.36 
 
 
858 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2521  translation initiation factor 2  91.77 
 
 
372 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  46.74 
 
 
799 aa  459  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  53.61 
 
 
787 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  48 
 
 
799 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  48.55 
 
 
941 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  47.87 
 
 
846 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  49.11 
 
 
769 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  45 
 
 
835 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  46.09 
 
 
842 aa  354  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  41.6 
 
 
762 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  44.7 
 
 
639 aa  307  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  38.27 
 
 
719 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  43.57 
 
 
790 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  36.96 
 
 
740 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  37.29 
 
 
741 aa  204  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  35.98 
 
 
680 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  29.51 
 
 
704 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  25.45 
 
 
784 aa  112  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  23.31 
 
 
848 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.79 
 
 
459 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  53.95 
 
 
472 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  46.05 
 
 
488 aa  80.1  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  50 
 
 
490 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  32.43 
 
 
438 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  34.97 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  44.44 
 
 
466 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  44.33 
 
 
341 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  38.76 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  38.76 
 
 
485 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  45.56 
 
 
487 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.8 
 
 
3409 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  29.65 
 
 
586 aa  54.7  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>