43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4954 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  100 
 
 
639 aa  1246    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  52.46 
 
 
842 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  48.87 
 
 
848 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  47.54 
 
 
874 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  45.99 
 
 
846 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  49.5 
 
 
871 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  47.18 
 
 
941 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  45.5 
 
 
835 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  47.27 
 
 
904 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  44.85 
 
 
787 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  45.45 
 
 
857 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  45.15 
 
 
856 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  44.9 
 
 
856 aa  316  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  50.44 
 
 
855 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  42.08 
 
 
769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  49.71 
 
 
858 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  47.64 
 
 
799 aa  308  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  47.03 
 
 
799 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  44.53 
 
 
907 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  49.1 
 
 
857 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  48.8 
 
 
857 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  43.96 
 
 
915 aa  300  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  42.22 
 
 
762 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  38.04 
 
 
719 aa  280  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  48.34 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  48.34 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  40.57 
 
 
740 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  38.33 
 
 
790 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  33.67 
 
 
741 aa  196  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  35.18 
 
 
680 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  30.39 
 
 
704 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.05 
 
 
784 aa  94.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  42.98 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  39.17 
 
 
438 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  24.68 
 
 
459 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  35.54 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  38.84 
 
 
490 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  21.95 
 
 
848 aa  64.3  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  36.67 
 
 
437 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  36.36 
 
 
472 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  37.61 
 
 
341 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  29.03 
 
 
3242 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  34 
 
 
487 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>