50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3510 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  72.45 
 
 		 787 aa  907    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  100 
 
 		 799 aa  1579    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  89.58 
 
 		 799 aa  1197    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  51.93 
 
 		 941 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  52.81 
 
 		 835 aa  505  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  44.54 
 
 		 907 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  43.67 
 
 		 857 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  43.55 
 
 		 857 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  42.88 
 
 		 848 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  53.05 
 
 		 874 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  44.56 
 
 		 915 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  40.81 
 
 		 857 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  53.23 
 
 		 871 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  41.15 
 
 		 856 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  51.96 
 
 		 904 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  40.14 
 
 		 856 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  41.69 
 
 		 855 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  42.03 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  47.38 
 
 		 846 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  48.32 
 
 		 769 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  48.31 
 
 		 842 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  61.74 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  61.74 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  48.08 
 
 		 639 aa  338  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  36.93 
 
 		 762 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  43.19 
 
 		 719 aa  327  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  39.36 
 
 		 740 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  46.04 
 
 		 790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  42.27 
 
 		 741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  36.99 
 
 		 680 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  33.09 
 
 		 704 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.93 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  24.6 
 
 		 459 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  35.19 
 
 		 438 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  37.87 
 
 		 472 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  36.78 
 
 		 466 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  51.95 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  37.06 
 
 		 437 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  35.96 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  27.92 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  31.68 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  31.68 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  32.67 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  25.61 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  41.94 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.02 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.06 
 
 		 2449 aa  55.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  33.8 
 
 		 2851 aa  53.9  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  20 
 
 		 3409 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  27.12 
 
 		 209 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>