89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3655 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  68.4 
 
 		 835 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  100 
 
 		 941 aa  1833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  57.49 
 
 		 787 aa  512  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  56.94 
 
 		 799 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  53.97 
 
 		 799 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  50.62 
 
 		 915 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  49.28 
 
 		 857 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  48.97 
 
 		 907 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  49.08 
 
 		 857 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  47.93 
 
 		 874 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  49.47 
 
 		 904 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  46.77 
 
 		 871 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  48.7 
 
 		 769 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  47.78 
 
 		 846 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  38.29 
 
 		 848 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  47.19 
 
 		 856 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  47.19 
 
 		 856 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  45.74 
 
 		 857 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  48.76 
 
 		 842 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  45.06 
 
 		 858 aa  360  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  57.88 
 
 		 367 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  57.88 
 
 		 367 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  45.13 
 
 		 855 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  48.67 
 
 		 639 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  41.76 
 
 		 762 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  44.41 
 
 		 719 aa  290  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  42.15 
 
 		 740 aa  283  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  41.38 
 
 		 790 aa  240  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  38.89 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  39.94 
 
 		 680 aa  208  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  32.35 
 
 		 704 aa  163  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  25.15 
 
 		 784 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  38.46 
 
 		 438 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  37.97 
 
 		 472 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.66 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  41.88 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 		 925 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  41.94 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  34.59 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  41.88 
 
 		 466 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  24.01 
 
 		 848 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 651 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  31.19 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  39.22 
 
 		 485 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  39.22 
 
 		 473 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  40.74 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  40.27 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  40.87 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  29.09 
 
 		 303 aa  62  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  42.52 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  27.52 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  41.6 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  41.6 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 581 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  43.36 
 
 		 330 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  31.4 
 
 		 228 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1450  putative phosphoserine phosphatase  18.43 
 
 		 286 aa  54.3  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  41.86 
 
 		 334 aa  54.3  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  62.26 
 
 		 295 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2705  hypothetical protein  18.54 
 
 		 296 aa  53.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.878489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.85 
 
 		 586 aa  52  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  33.12 
 
 		 342 aa  51.6  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  41.96 
 
 		 318 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  28.17 
 
 		 304 aa  51.2  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48676  predicted protein  23.82 
 
 		 4825 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.41 
 
 		 1211 aa  50.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2752  hypothetical protein  32.26 
 
 		 281 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  23.08 
 
 		 1458 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  25.48 
 
 		 958 aa  49.7  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 657 aa  49.7  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0292  hypothetical protein  19.85 
 
 		 286 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532885  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  29.44 
 
 		 744 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  17.74 
 
 		 3608 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  36.59 
 
 		 464 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1331  hypothetical protein  18.56 
 
 		 247 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  16.48 
 
 		 2906 aa  47.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03597  ubiquitination network signaling protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12790)  21.4 
 
 		 996 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  17.87 
 
 		 914 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  15.62 
 
 		 289 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 439 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.89 
 
 		 561 aa  46.2  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  30.15 
 
 		 958 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3068  acylphosphatase-like protein  32.71 
 
 		 235 aa  45.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.993658  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf492  massive surface protein MspE  12.95 
 
 		 2992 aa  44.7  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.712607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  65 
 
 		 281 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1356 aa  45.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0135  hypothetical protein  18.35 
 
 		 293 aa  44.3  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00185509  normal  0.0124096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28676  predicted protein  18.36 
 
 		 3600 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>