20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0874 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0874  60S ribosomal protein L19  100 
 
 		 304 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1424  LysR family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  43.53 
 
 		 307 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1281  6-phosphofructokinase  60.16 
 
 		 145 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  62.5 
 
 		 473 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0293  hypothetical protein  92.86 
 
 		 50 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.660472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2228  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  29.94 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  40.58 
 
 		 762 aa  71.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  60.67 
 
 		 449 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1970  hypothetical protein  70.21 
 
 		 50 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 550 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  59.76 
 
 		 442 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2733  hypothetical protein  58.7 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773119  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  30.82 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6356  DNA-directed RNA polymerase II, large subunit, putative  28.57 
 
 		 400 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803195 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  67.57 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5425  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 760 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.026993  normal  0.70686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2690  peptidase  29.63 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466836  normal  0.22304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1714  hypothetical protein  30.53 
 
 		 891 aa  42.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>