19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2206 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  430  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0285  hypothetical protein  52.89 
 
 
193 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000769793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1152  hypothetical protein  42.54 
 
 
173 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6737  hypothetical protein  31.03 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  21.89 
 
 
1675 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.401487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  17.24 
 
 
958 aa  55.5  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0962  hypothetical protein  29.89 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  21.32 
 
 
1347 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  31.41 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1945  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  20.59 
 
 
1347 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02600  hypothetical protein  23.78 
 
 
908 aa  48.5  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  26.67 
 
 
958 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  19.08 
 
 
1211 aa  45.4  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3053  hypothetical protein  34.09 
 
 
87 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.84397  hitchhiker  0.00135692 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0290  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04840  hypothetical protein  24.24 
 
 
803 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174249  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  21.79 
 
 
1092 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  23.71 
 
 
317 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>