22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0595 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  100 
 
 		 1675 aa  3401    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.401487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  21.84 
 
 		 3427 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  21.89 
 
 		 228 aa  57.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  20.47 
 
 		 958 aa  56.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5003  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1446 aa  55.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29473  predicted protein  21.63 
 
 		 399 aa  52.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.103987 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  51.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.600636 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  22.02 
 
 		 419 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  22.02 
 
 		 419 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  22.02 
 
 		 419 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  22.02 
 
 		 427 aa  49.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  22.02 
 
 		 419 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  22.02 
 
 		 427 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  22.02 
 
 		 427 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  22.02 
 
 		 427 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16519  predicted protein  22.78 
 
 		 331 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0258971  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  21.43 
 
 		 419 aa  47.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  22.49 
 
 		 239 aa  47.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1905  hypothetical protein  24.59 
 
 		 459 aa  47  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.418202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3763  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  46.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1031  hypothetical protein  22.22 
 
 		 964 aa  45.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.523239  normal  0.184922 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 421 aa  45.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>