82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1000 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  63.56 
 
 		 238 aa  294  7e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  63.56 
 
 		 238 aa  294  7e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  63.56 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  56.65 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  53.22 
 
 		 237 aa  254  8e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  54.04 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  53.14 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  51.93 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  44.21 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  26.51 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.36 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.7 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  23.22 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  27.43 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  31.19 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.51 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  41.41 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  30 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.27 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  26.32 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  27.46 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  24.78 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  24.07 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  24.11 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.9 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  27.78 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  25.98 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  24.48 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.57 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  24.48 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  24.79 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  24.48 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  27.16 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  24.5 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  28.86 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  26.69 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  22.86 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  23.78 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  21.46 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  28.85 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  26.32 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  26.07 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  21.7 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  24.18 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  29.69 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  28.21 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  23.83 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.87 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  29.55 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  23.5 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  25.91 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  24.35 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  24.03 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  21.67 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  19.92 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  29.67 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.52 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  22.49 
 
 		 1675 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.401487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  23.84 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  20.92 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  25.74 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  26.51 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.32 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  20.7 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1234 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  26.51 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  23.17 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.18 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  21.62 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  25.76 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  20.93 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  25 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  25.4 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  23.58 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  20.78 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0989  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.74 
 
 		 818 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.545373  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.48 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  32.2 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>