61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2312 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  69.92 
 
 		 246 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  65.59 
 
 		 247 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  54.66 
 
 		 253 aa  234  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  54.01 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  47.83 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  48 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  48.78 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  47.52 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  46.75 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  54.25 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  46.09 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  49.19 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  50 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  49.17 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  48.35 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  51.22 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  46.75 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  44.17 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  41.06 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  43.6 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  42.8 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  40.56 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  40.16 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  40.91 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  40.16 
 
 		 245 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  41.74 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  41.2 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  38.17 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  38.17 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  38.17 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  27.83 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  30.64 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.31 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  25.74 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  25.93 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.93 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.2 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  23.79 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  24.9 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  24.69 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  27.8 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  26.05 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  21.49 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.35 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.44 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  19.62 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  19.92 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.3 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  25.32 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.64 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  28.05 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  22.18 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  23.63 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.63 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  22.37 
 
 		 240 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 		 166 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>