56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6816 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  100 
 
 		 246 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  69.92 
 
 		 246 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  61.94 
 
 		 247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  54.66 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  52.32 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  49.21 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  48.59 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  49.19 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  47.97 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  47.39 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  49.38 
 
 		 242 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  50.61 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  45.04 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  48.76 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  46.56 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  41.46 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  43.62 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  46.72 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  43.6 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  47.46 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  46.61 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  44.18 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  39.43 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  40.24 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  40.66 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  39.68 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  39.75 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  40.32 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  40.41 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  40.41 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  40.41 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  41.13 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.13 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  27.12 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25.42 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  28.75 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.32 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  26.63 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  31.54 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  30.65 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  27.98 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  26.45 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.92 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  29.67 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  33.72 
 
 		 116 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  32.35 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  32.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.83 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  21.49 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25.41 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  24.39 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  29.77 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  22.31 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  23.38 
 
 		 238 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>