71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1954 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  51.82 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  48.99 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  49.21 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  48.18 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  48 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  48.03 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  44.3 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  43.32 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  41.34 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  46.25 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  43.32 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  40.89 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  41.67 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  41.63 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  40.6 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  36.48 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  38.27 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  37.08 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  36.84 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  40.65 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  38.15 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  37.14 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  37.35 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  33.33 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  36.59 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  36.59 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  36.59 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  35.32 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  31.5 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  30.68 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  31.82 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.06 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  28.15 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  28.75 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  29.46 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  29.47 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  25.82 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.32 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  24.4 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.07 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.24 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  28 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  25.13 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  27.53 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  23.5 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  21.4 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  24.63 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  23.64 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  21.21 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  24.19 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  24.38 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  26.97 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  20.43 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  24.03 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.39 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  19.51 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  21.43 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  20.17 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  20.17 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  24.02 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  22.37 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  23.67 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  23.48 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  29.89 
 
 		 116 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  23.11 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  26.06 
 
 		 240 aa  42  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  26.29 
 
 		 1682 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>