44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  100 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  63.27 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  53.47 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  49.19 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  47.24 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  47.7 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  48.37 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  46.12 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  47.68 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  48.99 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  46.75 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  44.58 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  48.56 
 
 		 245 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  47.54 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  44.94 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  42.45 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  48.03 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  47.92 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  47.92 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  47.92 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  41.63 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  44.62 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  48.18 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  44.77 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  39.92 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  45.41 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  41.91 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  43.9 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  40.83 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  36.03 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  36.07 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  34.02 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  29.05 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  30.77 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.18 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  26.86 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.1 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.7 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  25.29 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  21.81 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  22.7 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  24.7 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>