91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2442 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  29.57 
 
 
241 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  31.6 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  31.95 
 
 
238 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  31.38 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.66 
 
 
238 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  26.29 
 
 
243 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  33.95 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  26.18 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.44 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  26.84 
 
 
242 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  28.63 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  28.03 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  27.62 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  27.62 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.61 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  26.18 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  28.4 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25.86 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  27.24 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  25.43 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  26.59 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  30.4 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  24.47 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  33.91 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  30.64 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  23.08 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  25.93 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.44 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  27.01 
 
 
239 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.52 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.72 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  21.1 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  23.28 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  25.59 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  27 
 
 
235 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  24.57 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.51 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  21.85 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  22.78 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  22.03 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.61 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  22.03 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  24.17 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  27.56 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  20.8 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.59 
 
 
240 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  22.69 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.48 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  28.21 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  22.36 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  24.41 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  23.69 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  21.46 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  28.33 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  32.79 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  22.49 
 
 
251 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  28.27 
 
 
245 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  25.22 
 
 
237 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  32.19 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  28.09 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  29.92 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  22.22 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  25.97 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  22.22 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  28.22 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  20 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  21.67 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  35.03 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  27.92 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  26.97 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  31.54 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  28.28 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  27.7 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  24.83 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.27 
 
 
237 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  31.65 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  28.03 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  27.98 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  27.2 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  20.75 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  22.52 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  23.35 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  23.08 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
245 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  29.66 
 
 
249 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>