41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2443 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  474  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  82.45 
 
 
245 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  41.63 
 
 
245 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  42.91 
 
 
246 aa  148  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  41.74 
 
 
246 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  43.28 
 
 
237 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  40.33 
 
 
247 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  41.13 
 
 
246 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  42.86 
 
 
244 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  36.93 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  36.03 
 
 
245 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  39.27 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  38.31 
 
 
255 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  40.82 
 
 
249 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  36.21 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  35.22 
 
 
245 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  39.43 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  36.13 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  34.02 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  34.03 
 
 
245 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  32.64 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  33.61 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  31.69 
 
 
247 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  32.77 
 
 
245 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  34.82 
 
 
242 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  36.59 
 
 
246 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  31.12 
 
 
245 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  33.85 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  28.45 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  28.45 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  28.45 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  28.63 
 
 
246 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.03 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.32 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  21.49 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  22.76 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  28.1 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  31.37 
 
 
116 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  23.89 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.18 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>