48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2192 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
245 aa  473  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  82.45 
 
 
245 aa  384  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  40.91 
 
 
246 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  37.96 
 
 
245 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  40.32 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  41.22 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  39.51 
 
 
247 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  37.34 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  35.89 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  42.86 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  39.32 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  36.51 
 
 
245 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  36.21 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  35.43 
 
 
255 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  38 
 
 
253 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.07 
 
 
245 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  38.62 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  37.96 
 
 
249 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  33.48 
 
 
245 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  33.88 
 
 
245 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  32.38 
 
 
245 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  34.02 
 
 
245 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  32.23 
 
 
245 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  34.01 
 
 
242 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  32.79 
 
 
245 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  35.54 
 
 
246 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  29.84 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  34.57 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  28.75 
 
 
245 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  28.75 
 
 
245 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  28.75 
 
 
245 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  33.62 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  31.15 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  32.35 
 
 
244 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.15 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  26.97 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  27.18 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.58 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  23.79 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.01 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.66 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  24.39 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  23.23 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  23.23 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  23.23 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.24 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.7 
 
 
239 aa  42  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>