81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0479 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  96.2 
 
 		 238 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  61.76 
 
 		 238 aa  294  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  55.27 
 
 		 237 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  49.79 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  43.83 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  37.28 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  54.72 
 
 		 116 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  31.6 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  32.17 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  32.17 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  31.74 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  35.32 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  36.08 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  30.67 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  26.45 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  27.43 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  48.74 
 
 		 153 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  29.79 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.52 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  26.05 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.55 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  27.75 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.54 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  23.28 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  26.1 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  28.87 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  29.32 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  22.98 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  26.23 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  27.71 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  23.77 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  27.92 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.49 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.38 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.77 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  31.01 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  26.72 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  27.12 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.75 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.37 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  28.75 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  23.67 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  23.67 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.58 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  24.68 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  24.19 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.27 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.92 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.61 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  27.19 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  22.27 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.62 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  25.94 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  29.41 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  23.83 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25.93 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.69 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  25.85 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  25.96 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  26.23 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  26.09 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  24.15 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  28.08 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  26.4 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  24.89 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  26.77 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  28.57 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  22.99 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  26 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.62 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  25.33 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.47 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  24.26 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  22.98 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1279  hypothetical protein  34.94 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  21.29 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>