77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0540 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  53.14 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  51.84 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  52.72 
 
 		 249 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  52.3 
 
 		 247 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  48.74 
 
 		 256 aa  238  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  30.64 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  29.52 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  25.64 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  29.92 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  28.88 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.06 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.52 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  26.92 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  26.92 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25.97 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  26.07 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.57 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.09 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  27.11 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.11 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  25.43 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.28 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  23.65 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  26.72 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  26.29 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  26.29 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  31.46 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  23.33 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  22.94 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.9 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.74 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  22.88 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.53 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  25 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  24.32 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  25.56 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  24.36 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  25 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  23.95 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.13 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.07 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  23.57 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  21.81 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  24.03 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  24.89 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  24.69 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  23.25 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  23.28 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  22.48 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  25.11 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  24.69 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  21.93 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  19.91 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  26.22 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.52 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  22.55 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  22.18 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  20.31 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  22.41 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  24.32 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.17 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  22.13 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  21.95 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  22.28 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  22.42 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  24.11 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  21.55 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  20.93 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  20.87 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  26.98 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  22.04 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 		 1045 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  21.98 
 
 		 1214 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>