39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06960 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  33.89 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.61 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  25.88 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  27.62 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  25.1 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  23.68 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  24.27 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  24.07 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  24.07 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  24.07 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  25.37 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  23.01 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  27.85 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  25.87 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25.3 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  27.04 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  22.98 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  21.2 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  25.45 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  20.92 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.33 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  26.85 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  21.81 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  24.38 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  29.67 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  23.86 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  28.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  28.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  28.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  24.45 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  23.81 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  22.55 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  20 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  21.81 
 
 		 246 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  22.53 
 
 		 247 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  26.06 
 
 		 247 aa  42  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>