80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1624 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  74.49 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  68.98 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  63.11 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  51.22 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  52.3 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  30.53 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  30.6 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  31.03 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  31.54 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  31.54 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  31.8 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  25.43 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  34.48 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  24.05 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  33.73 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.59 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.68 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.36 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  28.4 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  28.15 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  25.11 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.1 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  22.27 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  28.46 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  24.8 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  22.71 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  22.71 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  22.71 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  25.32 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  23.14 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.69 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.56 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.05 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  24.11 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  23.36 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  25 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.52 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.4 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25.4 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  25.68 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  21.65 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  24.58 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  24.78 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  26.15 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  24.27 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.67 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  23.5 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  23.79 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  24.9 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  25.75 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  24.9 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  20.7 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  24.9 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  27.92 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  22.92 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  21.92 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  22.99 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  21.61 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  24.38 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  22.31 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  20.59 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  19.42 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  22.67 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  20.49 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1088 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  27.2 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  20.35 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  26.76 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.87 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  25.41 
 
 		 1145 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  20.95 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  21.05 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1110 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  19.8 
 
 		 252 aa  42  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>