69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5146 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  67.22 
 
 
251 aa  324  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  64.75 
 
 
248 aa  305  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  51.23 
 
 
247 aa  239  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  49.15 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  50.42 
 
 
261 aa  214  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  48.51 
 
 
261 aa  208  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  47.11 
 
 
254 aa  207  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  47.06 
 
 
251 aa  204  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  46.22 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  43.62 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  30.59 
 
 
266 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  30.8 
 
 
266 aa  91.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  29.66 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  33.21 
 
 
266 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  33.58 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  29.01 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  29.28 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  28.87 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  28.88 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.16 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  29.39 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  26.58 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  23.61 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  27.46 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.05 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  23.97 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  24.36 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  27.24 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.79 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  23.98 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  26.69 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  23.18 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  24.6 
 
 
234 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.18 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.5 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  25.1 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  26.21 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  22.59 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.75 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.67 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  27.02 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  22.69 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  27.04 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  28.79 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.42 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  27.59 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  24.49 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  27.47 
 
 
238 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  27.47 
 
 
238 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  34.78 
 
 
238 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  23.24 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  23.24 
 
 
247 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  23.24 
 
 
247 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.14 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  26.05 
 
 
246 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  24.17 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  30.53 
 
 
116 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  25 
 
 
1621 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  22.94 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  25.48 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  24.18 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  24.8 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.86 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  27.49 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  24.29 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>