69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0400 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  55.7 
 
 
238 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  55.27 
 
 
238 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  54.43 
 
 
238 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  48.93 
 
 
237 aa  218  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  44.26 
 
 
241 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  71.96 
 
 
116 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  40.89 
 
 
242 aa  161  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  70.59 
 
 
153 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  32.47 
 
 
262 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  29.83 
 
 
259 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  30.54 
 
 
247 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  30.54 
 
 
247 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  31.09 
 
 
246 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  32.52 
 
 
248 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  30.68 
 
 
243 aa  85.1  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  26.64 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  28.02 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  27.03 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  27.35 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  28.15 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.75 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.41 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  30.11 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  26.59 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  23.53 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  30.83 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  22.09 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  25.86 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  25.55 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  25.58 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.41 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  25.96 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.56 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  27.05 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  27.04 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  26.34 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  32.28 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  26.2 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  24.73 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.43 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  23.19 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  33.9 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  33.9 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  33.9 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  29 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  26.91 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  27.16 
 
 
247 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.85 
 
 
231 aa  52  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.84 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  25.43 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  27.22 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  26.58 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  25.56 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.41 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.15 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  23.48 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.03 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  25.53 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
699 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  28.03 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  25.23 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  33.33 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  28.33 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  26.7 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>