42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0974 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
268 aa  540  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  75.94 
 
 
269 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  72.73 
 
 
265 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  72.93 
 
 
266 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  71.05 
 
 
266 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  71.59 
 
 
266 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  71.43 
 
 
266 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  30 
 
 
250 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  31.54 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  31.94 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  29.66 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  28.36 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  28.02 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  25.1 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  27.86 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  28.36 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  28.3 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.06 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  26.39 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  25.19 
 
 
240 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  24.52 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  24.44 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  23.79 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  21.46 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  22.01 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  31.55 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  27.95 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  23.48 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.77 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  23.08 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.17 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  21.32 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  23.32 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.27 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  24.3 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  22.73 
 
 
958 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  29.51 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  29.51 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  29.51 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  21.01 
 
 
247 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  42  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>