49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1543 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
261 aa  511  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  65.9 
 
 
261 aa  338  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  65.64 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  51.25 
 
 
247 aa  228  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  48.77 
 
 
250 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  49.58 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  47.5 
 
 
248 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  48.51 
 
 
248 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  45.15 
 
 
251 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  41.56 
 
 
254 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  44.17 
 
 
262 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  28.31 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  26.91 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.11 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  28.36 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  25.65 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  26.39 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  26.53 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  27.16 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.48 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  26.45 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  26.79 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.23 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  26.69 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  27.73 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  28.94 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.96 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25.26 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.18 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  27.24 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
236 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  24.55 
 
 
246 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.27 
 
 
237 aa  52  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  29.55 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.22 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  25.97 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  29.78 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  23.77 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  24.39 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  24.5 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  22.86 
 
 
256 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  23.32 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  23.32 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  23.08 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.36 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  26.28 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  23.01 
 
 
248 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>