51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0656 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  485  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  29.71 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.8 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  28.33 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  27.39 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  24.28 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  26.8 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  25.1 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  27.19 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  28.05 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  24.3 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  27.52 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  25.19 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.23 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  22.46 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  25.79 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  30.73 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  27.02 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  24.59 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  25.94 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  23.31 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.25 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  27.7 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  24.29 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  24.66 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25.37 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  25.56 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  24.81 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  24.44 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  22.59 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  26.82 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  26.97 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  29.78 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  26.97 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  21.89 
 
 
269 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  26.48 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  25.25 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  23.5 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  23.87 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  23.5 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  23.5 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  27.23 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.47 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 
784 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  23.32 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  23.39 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  31.16 
 
 
1185 aa  42  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>