43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1111 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  84.09 
 
 
265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  79.32 
 
 
266 aa  431  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  78.79 
 
 
266 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  77.07 
 
 
266 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  73.48 
 
 
269 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  71.05 
 
 
268 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  32.05 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  30.8 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  29.62 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  32.84 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  28.24 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  27.95 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  30.74 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  27.24 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  27.07 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  27.24 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  25.65 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.57 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  21.56 
 
 
243 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  23.95 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.81 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  24.34 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  23.32 
 
 
237 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  22.83 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  27.2 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  22.87 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  22.22 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  23.32 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.4 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.03 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  25.45 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  22.18 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  27.63 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.52 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.22 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  26.55 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  25.48 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  24.14 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25.38 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  24.3 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  23.87 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>