41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1650 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  84.09 
 
 
266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  82.58 
 
 
266 aa  441  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  79.55 
 
 
269 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  80.38 
 
 
266 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  78.03 
 
 
266 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  72.73 
 
 
268 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  32.68 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  30.42 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  30.92 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  27.67 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  29.28 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  26.77 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  26.07 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  26.52 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  29.85 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  28.36 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  27.17 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.22 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  23.31 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  24.72 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  24.03 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  23.66 
 
 
249 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  21.93 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  20 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  22.48 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  29.84 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  22.4 
 
 
240 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  21.74 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.74 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  23.88 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  21.51 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  25.9 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  20.47 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  27.94 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  27.94 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  27.94 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  26.87 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  27.54 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  28.12 
 
 
235 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.21 
 
 
238 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>