37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1555 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 266 aa  536  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  82.2 
 
 		 266 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  82.58 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  79.32 
 
 		 266 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  80.45 
 
 		 266 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  76.32 
 
 		 269 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  72.93 
 
 		 268 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  33.85 
 
 		 251 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  30.27 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  33.21 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  29.66 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  28.29 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  29.32 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  27.63 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  29.39 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  26.91 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  24.8 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  27.41 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  24.05 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  23.57 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.56 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  25.56 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  28.23 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  23.64 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  21.67 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  23.85 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  23.64 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.84 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  23.32 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  21.18 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  29.51 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.74 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  29.51 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  29.51 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>