17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1218 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.45 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  31.55 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  28.23 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  23.76 
 
 
958 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  25.45 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  29.84 
 
 
265 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  29.91 
 
 
269 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  25.96 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  26.73 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  27.33 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  17.75 
 
 
1211 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  26.24 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  25.86 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  21.61 
 
 
1154 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  19.5 
 
 
243 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>