38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0341 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  85.28 
 
 		 231 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  81.39 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.79 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.82 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.43 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  24.69 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  25 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  27.1 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  25.2 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  27.63 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.35 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  25.11 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  28.36 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  27.57 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  26.62 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  22.77 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  23.16 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25.23 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  29.01 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  23.73 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  24.17 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  26.2 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  28.11 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  24.52 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  21.26 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  22.22 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  27.74 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.94 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  24.06 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  24.29 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  23.78 
 
 		 239 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  25 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>