44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2458 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  27.43 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  22.79 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.12 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  28.28 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  21.53 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  24.06 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  22.37 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  18.6 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.48 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  21.18 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  21.23 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  22.81 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  32.26 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  25.69 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  30.48 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  22.17 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  21.2 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  18.98 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  22.3 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  22.13 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  23.18 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  28.48 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  24 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  23.87 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  24.52 
 
 		 275 aa  45.4  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  22.67 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.76 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  24 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  29.14 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  26.98 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  27.78 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  23.27 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  23.87 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  23.08 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  30.08 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  29.03 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  31.71 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  21.49 
 
 		 245 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl318  beta-glucoside PTS system IIABC component  34.04 
 
 		 854 aa  42  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262813  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  26.79 
 
 		 958 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  23.47 
 
 		 247 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>