53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4816 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  467  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  47.97 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  46.12 
 
 
245 aa  191  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  48.37 
 
 
245 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  43.27 
 
 
245 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  44.44 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  45.34 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  45.78 
 
 
246 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  44.31 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  43.6 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  46.25 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  44.35 
 
 
242 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  44.9 
 
 
247 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  158  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  40.93 
 
 
237 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  41.6 
 
 
253 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  38.91 
 
 
242 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  40.25 
 
 
245 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  41.83 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  35.92 
 
 
245 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  38.78 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  40.76 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  38.87 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  40.82 
 
 
244 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  35.8 
 
 
245 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  36.93 
 
 
245 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  36.93 
 
 
245 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  36.93 
 
 
245 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  41.7 
 
 
247 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  38.59 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  32.38 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  31.12 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  28.45 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.09 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  28.76 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.74 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.69 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  26.67 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  32.24 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  24.34 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.62 
 
 
237 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  21.55 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  45.4  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.33 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  23.38 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.22 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  27.49 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.66 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  24.8 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.06 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.71 
 
 
240 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  30.07 
 
 
237 aa  42  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>