67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1251 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
256 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  61.76 
 
 
246 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  63.11 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  60.32 
 
 
249 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  47.33 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  48.74 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  27.54 
 
 
248 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  30.86 
 
 
242 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  27.88 
 
 
236 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  31.36 
 
 
247 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  31.36 
 
 
247 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  31.36 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.34 
 
 
246 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  27.43 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  27.85 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  28.75 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  27.87 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  24.58 
 
 
237 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  26.34 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.4 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.67 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  26.96 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.1 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.42 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.64 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  25.82 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  32 
 
 
116 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  24.36 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  27.24 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  23.14 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  20.94 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  25.51 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  22.46 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  22.46 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  22.32 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  23.66 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  21.46 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  24.47 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  20.59 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  20.59 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  22.47 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  26.09 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  22.51 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  26.19 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.01 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  25.51 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  20.54 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  21.21 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  28.05 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  24.04 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  22.22 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  25.34 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  22.86 
 
 
261 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.33 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  23.29 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  24 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  22.67 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.2 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  21.74 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  27.63 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  21.79 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  21.58 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  22.1 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  26.38 
 
 
266 aa  42  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>