23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0733 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.88 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  23.48 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  22.88 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  30.43 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  30.86 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  26.09 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  29.07 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  28.05 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  29.07 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  30.67 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  29.07 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  26.38 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  33.77 
 
 		 116 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  22.27 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  24.8 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  28.92 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.16 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  29.55 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  24.39 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>