76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1209 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  32.08 
 
 
243 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  29.05 
 
 
247 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  27.54 
 
 
256 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  32.02 
 
 
237 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  23.93 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  30.26 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  36.08 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  31.92 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  30 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  33.85 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  30.52 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  30.52 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.64 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.54 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  33.15 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  25.42 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  33.52 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  28.94 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  24.88 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  26.59 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  24.12 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  27.62 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.85 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  27.19 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  25.11 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  29.91 
 
 
116 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  25.44 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  26.69 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  26.32 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  23.32 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  28.11 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  30.24 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  29.15 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  28.25 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  28.28 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  32.84 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  27.35 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  24.77 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  25.13 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.33 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  26.09 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  25.13 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.96 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  22.97 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.32 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  22.18 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  22.94 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  29.91 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  23.85 
 
 
266 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  23.35 
 
 
235 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  39.73 
 
 
153 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  21.79 
 
 
266 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  22.37 
 
 
262 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  21.74 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  24.2 
 
 
239 aa  45.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.39 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.1 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.41 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  24.2 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  21.03 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.5 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  27.57 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  27.03 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  27.03 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  23.74 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  31.61 
 
 
1019 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  21.79 
 
 
245 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  22.86 
 
 
244 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  23.01 
 
 
261 aa  42  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>