57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0250 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  41.32 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  38.8 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.75 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  27.83 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  27.08 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.02 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  26.45 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  26.41 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  26.61 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  35.51 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  27 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  38.81 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  25.74 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  26.07 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  23.83 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  26.42 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  34.95 
 
 		 116 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  23.87 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.79 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  21.99 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  32.81 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.83 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  24.8 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  32.5 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  23.98 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  24.17 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  22.67 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  27.88 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  26.25 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  26.52 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  25.74 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  24.9 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  25.34 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  21.34 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.97 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  25.9 
 
 		 265 aa  45.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  26.39 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  26.16 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  21.32 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  22.22 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  25.23 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  24.31 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  24.9 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  20.93 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  20.39 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  20.39 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  22.32 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  31.15 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  23.95 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  25.21 
 
 		 247 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  23.38 
 
 		 246 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  27.37 
 
 		 238 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  20.79 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  27.68 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>