43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0880 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 245 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  63.27 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  53.06 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  46.53 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  46.86 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  45.78 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  48.15 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  46.47 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  47.15 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  43.27 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  45.31 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  41.46 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  45.87 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  45.87 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  45.87 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  39.18 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  41.06 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  40.51 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  43.27 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  38.46 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  41.3 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  41.84 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  41.7 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  39.75 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  37.3 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  42.11 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  36.84 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  39.66 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  37.96 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  40.97 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.76 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  32.79 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  32.23 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.53 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  30.08 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  22.77 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.7 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  23.27 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  29.92 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  23.76 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.35 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  24.9 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>