27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_302 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  80.95 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  85.28 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.34 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  25.82 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  26.63 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25.93 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.68 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  26.64 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  25.16 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  30.24 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  29.02 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  26.36 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  25.79 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.49 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  25.44 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.29 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  23.19 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.08 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  23.76 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  27.27 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  23.38 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  26.24 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  23.26 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  24.86 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  26.98 
 
 		 245 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>