61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5075 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  70.04 
 
 		 247 aa  328  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  54.25 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  53.16 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  50.61 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  53.04 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  48.99 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  48.18 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  48.99 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  45.34 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  43.03 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  46.47 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  47.2 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  48.76 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  42.45 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  42.63 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  43.6 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  45.15 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  39.58 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  43.72 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  46 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  42.51 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  40.4 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  41.91 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  38.37 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  36.33 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  36.33 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  36.33 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  33.86 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.25 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.36 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.95 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  25.1 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  37.45 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  22.08 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.11 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  20 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.93 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  23.2 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  24.68 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.68 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  23.08 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  21.2 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  18.75 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  29.1 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  22.62 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  27 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  23.27 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  22.03 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  21.12 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.46 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  21.23 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.11 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03597  ubiquitination network signaling protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12790)  27.74 
 
 		 996 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  20 
 
 		 238 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  20 
 
 		 238 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>