61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  100 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  63.52 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  63.11 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  58.09 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  55.14 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  49.17 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  51.63 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  45.27 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  44.18 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  45.3 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  43.21 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  42.62 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  43.93 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  45 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  40.25 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  38.27 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  40.83 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  42.98 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  39.83 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  40.82 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  38.21 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  42.08 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  36.99 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  40.17 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  37.96 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  35.25 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  35.48 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  35.18 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  35.42 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  33.61 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  32.38 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  32.38 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  32.38 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.44 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  26.81 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  35.51 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  27.07 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.87 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.62 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  25.1 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  26.71 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  26.54 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  39.06 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25.93 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.62 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  29.91 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  24.5 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.92 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  32.68 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  18.42 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.61 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  28.27 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  20 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  23.92 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  21.96 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  23.03 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>