53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3356 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  91.02 
 
 		 245 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  50.2 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  48.59 
 
 		 246 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  46.53 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  47.97 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  49.19 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  48.95 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  45.82 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  42.45 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  46.84 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  43.67 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  43.67 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  46.06 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  43.32 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  46.94 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  40.74 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  40.51 
 
 		 242 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  40.87 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  45.34 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  40.91 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  44 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  40.91 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  40.91 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  38.49 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  41.42 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  40.25 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  38.04 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  39.76 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  39.48 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  36.1 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  25.22 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.63 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  29.1 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25.15 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.04 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.36 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  30.46 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.27 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  24.02 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  26.27 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.52 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  23.23 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.61 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.35 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  20.78 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  20.26 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  23.39 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  21.79 
 
 		 248 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  26.98 
 
 		 231 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>