53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2891 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  79.51 
 
 
245 aa  357  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  59.43 
 
 
245 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  59.43 
 
 
245 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  59.43 
 
 
245 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  55.37 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  48.15 
 
 
245 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  48.56 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  45.93 
 
 
246 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  43.7 
 
 
245 aa  171  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  38.49 
 
 
245 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  39.68 
 
 
246 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  40.16 
 
 
246 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  38.87 
 
 
245 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  38.37 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  39.34 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  39.08 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  42.04 
 
 
247 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  37.04 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  37.04 
 
 
245 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  36.69 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  37.14 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  36.21 
 
 
242 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  38.06 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  33.88 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  39.2 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  32.24 
 
 
245 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  36.18 
 
 
245 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  40 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  34.71 
 
 
246 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  37.19 
 
 
244 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  35.22 
 
 
234 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  35.18 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  24.69 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.85 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  37.34 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  22.76 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.5 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  19.92 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  21.9 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.39 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.14 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.26 
 
 
231 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  23.29 
 
 
239 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  23.19 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  22.32 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.27 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  34.67 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  22.31 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  24.22 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  21.26 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  25.32 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  34.41 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>