71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2904 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  60.73 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  54.66 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  54.66 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  48.95 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  46.15 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  44.94 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  45.82 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  47.11 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  44.26 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  51.21 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  43.82 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  38.46 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  41.74 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  42.74 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  42.51 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  43.39 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  43.21 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  41.6 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  40.25 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  38.46 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  36.84 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  40.32 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  36.69 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  39.27 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  38.27 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  37.96 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  37.96 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  37.96 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  36.63 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  29.19 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.07 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  31.01 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  26.72 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  27.43 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.41 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  30.19 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.05 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  26.32 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  32.28 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  20.33 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  22.86 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  21.81 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  22.75 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.5 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  26.64 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  23.98 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.37 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  28.4 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  23.91 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  22.8 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  25.91 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  24.06 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  21.23 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  19.56 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  19.56 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  24.39 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  23.73 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  21.01 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  23.17 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  24.08 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  22.06 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25.5 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  20.73 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  24.32 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  22.63 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>