58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3335 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 247 aa  471  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  51.04 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  52.02 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  51.22 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  48.57 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  51.22 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  53.44 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  51.87 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  50.21 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  46.94 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  47.01 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  49.79 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  44.9 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  43.27 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  47.76 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  45.71 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  48.21 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  46.84 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  46.06 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  45.3 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  43.65 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  43.5 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  40.65 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  43.95 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  46 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  40.65 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  39.43 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  35.92 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  39.2 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  36.82 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  24.44 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  32.19 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.25 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  21.1 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.53 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  24.15 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  22.52 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.51 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  22.36 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.87 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  25.7 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.1 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  28.76 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  21.9 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  21.9 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.21 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  25.67 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  20.21 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.69 
 
 		 239 aa  42  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>