81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0496 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  96.2 
 
 
238 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  61.18 
 
 
238 aa  289  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  54.43 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  48.93 
 
 
237 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  45.11 
 
 
241 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  36.84 
 
 
242 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  52.83 
 
 
116 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  31.95 
 
 
259 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  32.61 
 
 
247 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  32.61 
 
 
247 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  32.17 
 
 
262 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  35.82 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  31.09 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  33.85 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  27.85 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  25.62 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3084  hypothetical protein  47.9 
 
 
153 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  26.09 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  27.2 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  28.51 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  29.79 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.71 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  30.89 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.12 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  25.7 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  22.84 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  28.88 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  29.71 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.41 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  28.1 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  29.87 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  23.4 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  27.53 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.36 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.49 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.51 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  27.08 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  24.18 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  24.18 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  23.73 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  29.46 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  25.11 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  26.03 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.83 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  23.36 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  28.75 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  23.98 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.61 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  30.19 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  26.36 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  26.75 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25.2 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  25.64 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  26.61 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  28.99 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  28.1 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  26.64 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  27.24 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.79 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  23.53 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  27.22 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  27.2 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  29.45 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  27.95 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  27.47 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  26.92 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  29.57 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.47 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  24.8 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  23.11 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0157  hypothetical protein  23.81 
 
 
751 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 
877 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  24.8 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  25.19 
 
 
266 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  24.26 
 
 
231 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  27.45 
 
 
903 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>