73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3124 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  67.22 
 
 
248 aa  324  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  65.56 
 
 
248 aa  308  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  50.42 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  49.19 
 
 
247 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  45.38 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  47.46 
 
 
261 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  47.9 
 
 
251 aa  206  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  44.54 
 
 
259 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  45.15 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  43.22 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  32.46 
 
 
266 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  32.68 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  31.13 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  33.85 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  32.05 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  31.94 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.94 
 
 
244 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  30.74 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  25.87 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  29.41 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  26.02 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.58 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.02 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  26.85 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  26.83 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  29.3 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  25.29 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  25.94 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  25.21 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  25.1 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  26.05 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  29.1 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  25.51 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  23.83 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  30.34 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.2 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.63 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25.21 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  28.85 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  26.07 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  26.25 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  20.26 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  24.69 
 
 
248 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  22.49 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  41.38 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  41.38 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  41.38 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  28.34 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  24.8 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  25.17 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.63 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  30.69 
 
 
116 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  23.36 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  22.08 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  25.9 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  27.93 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  23.31 
 
 
247 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30 
 
 
272 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  24.9 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  25.2 
 
 
234 aa  45.4  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  28.02 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  24.9 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  26.83 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  31.25 
 
 
1476 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  24.29 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  24.32 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  21.6 
 
 
244 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>