59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1347 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  36.48 
 
 
252 aa  135  5e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  28.94 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  28.46 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  26.64 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  30.29 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  28.31 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  25.99 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  25.73 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  22.41 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.7 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  29.13 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  27.48 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  22.08 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  25.52 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  24.54 
 
 
238 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  25.1 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  36.23 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  21.83 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  25.81 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  26.99 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  26.99 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  26.99 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  27.73 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  23.45 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  27.56 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  27.61 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  26.63 
 
 
958 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  26.19 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  28.87 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  23.93 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  27.61 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  27.59 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  24.15 
 
 
234 aa  53.5  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  28.7 
 
 
116 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  25.17 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.78 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  24.74 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  23.95 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  24.4 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  30.97 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  21.43 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  22.27 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  23.77 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  21.47 
 
 
240 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  25 
 
 
242 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.74 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  25.57 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  28.17 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  28.17 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  29.17 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  21.96 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  23.36 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  28.17 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  18.49 
 
 
239 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  23.83 
 
 
261 aa  42  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>