70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0258 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
249 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  74.49 
 
 
247 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  71.02 
 
 
246 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  60.32 
 
 
256 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  52.72 
 
 
245 aa  248  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  49.79 
 
 
243 aa  248  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  30.97 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  32.37 
 
 
243 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  33.06 
 
 
262 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  31.12 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  31.12 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  35.06 
 
 
246 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  28.21 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  27.63 
 
 
238 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  23.28 
 
 
238 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.58 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  24.47 
 
 
259 aa  85.1  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  26.56 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  22.84 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  26.64 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.02 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  25.42 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.4 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  26.07 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  26.32 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.03 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  25.11 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  36.73 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  27.57 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  24.46 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  24.36 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  23.14 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  23.14 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  26.09 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  26.29 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  24.47 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  26.23 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  23.14 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  26.02 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  25.66 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  25.43 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  21.85 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  23.46 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  23.79 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  23.79 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  26.07 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  23.66 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  26.62 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  23.79 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  22.67 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  25.57 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  24.69 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  24.81 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  23.75 
 
 
269 aa  52  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0387  protein of unknown function DUF164  24.58 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0154383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  24.91 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  20.75 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.87 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  23.72 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  20.48 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  20.92 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  38.64 
 
 
275 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  22.9 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  18.91 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  28.71 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  19.75 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  19.82 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  21.98 
 
 
246 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>